糞便系大腸菌群及び大腸菌は、一般細菌数、腸球菌、大腸菌群などと同様に汚染指標菌の一つであり、より適切な環境でより安全性が高い食品を生産するための環境衛生管理上の指標として用いられており、主な検査対象は、生肉、生野菜、生鮮魚介類などの未加熱食品です。大腸菌が検出されることは、比較的新しい糞便汚染を受けた可能性が示唆され、また、大腸菌群による汚染よりも、より不潔な扱いがなされたことが推測されます。
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